Mikroskop compound memiliki lensa okuler 10 kali dan lensa obyektif 4,10, 40 dan 100 kali. Mikroskop digunakan untuk pemeriksaan obyek dengan perbesaran minimal 100 kali. Sebagai contoh pemeriksaan sporozoit plasmodium malaria, parasit malaria. Cara menggunakan mikroskop sebagai berikut;
Obyek diletakkan diatas meja benda.
Lensa obyektif ukuran paling kecil dipasang untuk memastikan posisi obyek yang akan diamati.
Untuk pengamatan selanjutnya lensa obyektif yang digunakan sesuai dengan kebutuhan dalam pengamatan.
Alat ini digunakan pada penelitian di Kecamatan Tanjung Bunga, Kabupaten Flores Timur tahun 1996 s/d 1998.